El complejo industrial de Monzón (Huesca), el mayor foco de contaminación de esta Comunidad, sufre los vertidos de fábricas como la de cloro-álcali de Química del Cinca y la planta de PVC del Grupo Ercros. Hay que destacar también la contaminación generada por la planta de Montecinca, S.A., a la que la Administración ha permitido verter DDT al río Cinca hasta octubre del 2007, un caso único en Europa.
Sabiñánigo es otro de los puntos más afectados por la contaminación por la planta de fabricación de cloro y derivados de Ercros, que vierte al río Gállego. Además, entre 1975 y 1989 esta planta produjo lindano, una actividad que generó 100.000 toneladas de residuos. Estos contaminantes continúan, en su mayoría, en vertederos próximos a la fábrica.

La papelera La Montañanesa de la empresa Sarrió Papel (Zaragoza) es un importante foco contaminante del río Ebro. Las fábricas de papel emplean  sustancias químicas altamente tóxicas como el dióxido de azufre (causante de la lluvia ácida), el dióxido de cloro, clorofenoles (organoclorados), hipoclorito, dioxinas y furanos que son vertidos a la atmósfera y al medio hídrico (ríos y costas) y que pueden provocar trastornos en el sistema inmunológico, nervioso y reproductor debido a sus compuestos cancerígenos y mutagénicos. Recientemente, La Montañanesa ha sido condenada por el Tribunal Superior de Justicia de Aragón por delito ecológico a consecuencia de sus vertidos al río, a raíz de las denuncias de Greenpeace realizadas en 1992.