Esta zona posee una figura de protección de la Red Natura 2000 de la UE, puesto que se encuentra dentro del Lugar de Importancia Comunitaria “Fondos Marinos de las Marismas del Río Palmones”.

La imagen de la Bahía de Algeciras está tristemente asociada a la contaminación. La responsabilidad de esta imagen la tienen las administraciones públicas que permiten que la comarca mantenga un desarrollo industrial insostenible, un deterioro constante de la salud pública y un tráfico marítimo descontrolado.

“Sólo acabando con la contaminación y los vertidos continuados se podrá mejorar de alguna manera la situación de la Bahía de Algeciras. La presión industrial, el crecimiento portuario y la desidia política son, a día de hoy, sus estandartes”, ha declarado Sara del Río, responsable de la campaña de Contaminación de Greenpeace.- “La Junta de Andalucía debería resolver este problema si quiere mejorar la imagen de la bahía y que pueda empezar a vincularse de nuevo con los valores naturales que posee en vez de por su deterioro."