« Sur la piste des Baleines » suit la migration des baleines à bosse des eaux tropicales du Pacifique Sud où elles se reproduisent, en passant par l'Océan Austral puis de l'Antarctique où elles se nourrissent.
Les baleines rejoignent le Sanctuaire des Baleines de l'Océan Austral, qui devrait être un lieu préservé pour elles. Malheureusement, elles sont aussi chassées dans cette zone.
Greenpeace défend les baleines depuis toujours grâce à ses activistes s'interposant entre les baleines et les bateaux de pêche. C'est pourquoi, nous ne laisserions jamais une baleine en danger. Les coordonnées géographique des baleines sont données avec quelques jours de retard afin d'empêcher les baleiniers de les localiser.
En outre, les flottes japonaises sont contraintes de suivre des voies strictement balisées de recherches. Malgré cela, les baleiniers prennent des chemins transversaux pour disent-ils « prendre des échantillons au hasard ». La localisation par satellite permet de rendre visible la moindre déviation d'une baleine ou de son groupe, ce qui décrédibiliserait automatiquement leur soi-disant programme « scientifique ».