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Desafortunadamente, este ecosistema se encuentra amenazado.
En México, la cobertura original de manglar ha perdido más del 65%. Se estima que actualmente sólo quedan alrededor de 660 mil hectáreas en todo el país, es decir, apenas el 1% de nuestros bosques o el 0.3% del territorio nacional.
Las principales amenazas contra los manglares son la tala inmoderada para la ampliación de la frontera agrícola-ganadera, la destrucción ocasionada por desarrollos turísticos y urbanos, y, sobre todo, la construcción de granjas camaronícolas.